Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pggt1bQ8BUY9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms