Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d3Q8BJ83 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms