Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trmt12Q8BG71 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trmt12Q8BG71 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms