Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms