Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnkQ7TSL0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnkQ7TSL0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms