Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms