Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms