Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ckap2lQ7TS74 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms