Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Uhrf2Q7TMI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms