Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScocQ78YZ6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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