Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme8Q715T0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms