Protein–RNA interactions for Protein: Q6R653

Unc5cl, UNC5C-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5clQ6R653 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Unc5clQ6R653 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Unc5clQ6R653 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms