Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms