Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gramd2bQ6PEM6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms