Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf1cQ6PDZ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms