Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms