Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SvoplQ6PDF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms