Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms