Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl2Q6PA06 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl2Q6PA06 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms