Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc4Q6P2L7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc4Q6P2L7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms