Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf9bQ6NZA9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms