Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Szrd1Q6NXN1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms