Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltv1Q6NSQ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ltv1Q6NSQ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms