Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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