Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc18Q640L5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc18Q640L5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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