Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PatjQ63ZW7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PatjQ63ZW7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms