Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup62Q63850 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms