Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp4Q62445 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp4Q62445 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms