Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms