Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddr2Q62371 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr2Q62371 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms