Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms