Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp1Q62209 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms