Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema4bQ62179 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema4bQ62179 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema4bQ62179 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema4bQ62179 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema4bQ62179 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema4bQ62179 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema4bQ62179 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema4bQ62179 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema4bQ62179 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema4bQ62179 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema4bQ62179 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms