Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Phox2aQ62066 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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