Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt33bQ61897 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms