Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrn1Q61809 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn1Q61809 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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