Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms