Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga7Q61738 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga7Q61738 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms