Protein–RNA interactions for Protein: Q61704

Itih3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih3Q61704 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itih3Q61704 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itih3Q61704 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms