Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms