Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccne1Q61457 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne1Q61457 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms