Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vsx2Q61412 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms