Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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BcanQ61361 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcanQ61361 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcanQ61361 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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BcanQ61361 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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BcanQ61361 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcanQ61361 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.9 ms