Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TmpoQ61033 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TmpoQ61033 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TmpoQ61033 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms