Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf3Q60980 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms