Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp4Q60972 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms