Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DbpQ60925 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms