Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Neurod1Q60867 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms