Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms