Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms